MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori HPAG1 chromosome

Total Repeats: 33308

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008086	CAT	2	6	19	24	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008086	T	6	6	24	29	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008086	AC	3	6	60	65	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008086	CA	3	6	76	81	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008086	ATT	2	6	202	207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008086	T	6	6	210	215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008086	CCT	2	6	268	273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_008086	T	7	7	350	356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008086	GTT	2	6	367	372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008086	TTAAA	2	10	440	449	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008086	A	7	7	504	510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008086	CTT	2	6	537	542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562425
13	NC_008086	ATGC	2	8	589	596	25 %	25 %	25 %	25 %	108562425
14	NC_008086	CAA	2	6	761	766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108562425
15	NC_008086	CGC	2	6	819	824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108562425
16	NC_008086	T	6	6	856	861	0 %	100 %	0 %	0 %	108562425
17	NC_008086	TTTC	2	8	881	888	0 %	75 %	0 %	25 %	108562425
18	NC_008086	CTT	2	6	890	895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562425
19	NC_008086	CAT	2	6	896	901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108562425
20	NC_008086	TTC	2	6	906	911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562425
21	NC_008086	CTT	2	6	916	921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562425
22	NC_008086	TGTTC	2	10	941	950	0 %	60 %	20 %	20 %	108562425
23	NC_008086	TTG	2	6	973	978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562425
24	NC_008086	CA	3	6	1000	1005	50 %	0 %	0 %	50 %	108562425
25	NC_008086	TTCT	2	8	1094	1101	0 %	75 %	0 %	25 %	108562425
26	NC_008086	ATC	2	6	1116	1121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108562425
27	NC_008086	T	6	6	1169	1174	0 %	100 %	0 %	0 %	108562425
28	NC_008086	CAAA	2	8	1202	1209	75 %	0 %	0 %	25 %	108562425
29	NC_008086	ATT	2	6	1275	1280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008086	TTA	2	6	1301	1306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008086	AAAC	2	8	1308	1315	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_008086	T	6	6	1462	1467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008086	AAT	2	6	1480	1485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008086	T	6	6	1499	1504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008086	GAGC	2	8	1546	1553	25 %	0 %	50 %	25 %	108562426
36	NC_008086	CATT	2	8	1632	1639	25 %	50 %	0 %	25 %	108562426
37	NC_008086	GAT	3	9	1640	1648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108562426
38	NC_008086	TTCT	2	8	1777	1784	0 %	75 %	0 %	25 %	108562426
39	NC_008086	GTT	2	6	1823	1828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562426
40	NC_008086	T	7	7	1836	1842	0 %	100 %	0 %	0 %	108562426
41	NC_008086	T	7	7	1864	1870	0 %	100 %	0 %	0 %	108562426
42	NC_008086	TTC	2	6	1874	1879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562426
43	NC_008086	ACA	2	6	1900	1905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108562426
44	NC_008086	C	6	6	1918	1923	0 %	0 %	0 %	100 %	108562426
45	NC_008086	AAT	2	6	1975	1980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108562427
46	NC_008086	C	6	6	2160	2165	0 %	0 %	0 %	100 %	108562427
47	NC_008086	CT	3	6	2209	2214	0 %	50 %	0 %	50 %	108562427
48	NC_008086	CTT	2	6	2318	2323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562427
49	NC_008086	TCTG	2	8	2328	2335	0 %	50 %	25 %	25 %	108562427
50	NC_008086	TGA	2	6	2336	2341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108562427
51	NC_008086	TTGCAA	2	12	2385	2396	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	108562427
52	NC_008086	AAAT	2	8	2430	2437	75 %	25 %	0 %	0 %	108562428
53	NC_008086	TCA	2	6	2476	2481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108562428
54	NC_008086	CCG	4	12	2561	2572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108562428
55	NC_008086	CCA	2	6	2705	2710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108562428
56	NC_008086	GCT	2	6	2730	2735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108562428
57	NC_008086	CA	3	6	2744	2749	50 %	0 %	0 %	50 %	108562428
58	NC_008086	T	6	6	2761	2766	0 %	100 %	0 %	0 %	108562428
59	NC_008086	CTA	2	6	2797	2802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108562428
60	NC_008086	T	6	6	2865	2870	0 %	100 %	0 %	0 %	108562428
61	NC_008086	ATA	2	6	2878	2883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108562428
62	NC_008086	GGC	2	6	2921	2926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108562428
63	NC_008086	GCC	2	6	2965	2970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108562428
64	NC_008086	GCTT	2	8	2973	2980	0 %	50 %	25 %	25 %	108562428
65	NC_008086	CT	3	6	3079	3084	0 %	50 %	0 %	50 %	108562428
66	NC_008086	TAAAA	2	10	3119	3128	80 %	20 %	0 %	0 %	108562428
67	NC_008086	GTT	2	6	3141	3146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562428
68	NC_008086	CTT	2	6	3175	3180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562428
69	NC_008086	G	6	6	3231	3236	0 %	0 %	100 %	0 %	108562428
70	NC_008086	TTC	2	6	3280	3285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562429
71	NC_008086	A	7	7	3295	3301	100 %	0 %	0 %	0 %	108562429
72	NC_008086	ATTATA	2	12	3313	3324	50 %	50 %	0 %	0 %	108562429
73	NC_008086	CCTG	2	8	3328	3335	0 %	25 %	25 %	50 %	108562429
74	NC_008086	CCAA	2	8	3352	3359	50 %	0 %	0 %	50 %	108562429
75	NC_008086	TGAA	2	8	3392	3399	50 %	25 %	25 %	0 %	108562429
76	NC_008086	GTT	2	6	3415	3420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562429
77	NC_008086	T	6	6	3494	3499	0 %	100 %	0 %	0 %	108562429
78	NC_008086	CTT	2	6	3504	3509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108562429
79	NC_008086	TGG	2	6	3561	3566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108562429
80	NC_008086	TCA	3	9	3569	3577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108562429
81	NC_008086	TGAA	2	8	3580	3587	50 %	25 %	25 %	0 %	108562429
82	NC_008086	AAT	2	6	3622	3627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108562429
83	NC_008086	TAG	2	6	3675	3680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108562429
84	NC_008086	G	6	6	3707	3712	0 %	0 %	100 %	0 %	108562429
85	NC_008086	GATTA	2	10	3766	3775	40 %	40 %	20 %	0 %	108562429
86	NC_008086	TTTG	2	8	3822	3829	0 %	75 %	25 %	0 %	108562429
87	NC_008086	ATTC	2	8	3867	3874	25 %	50 %	0 %	25 %	108562429
88	NC_008086	GTTTT	2	10	3945	3954	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008086	A	8	8	4060	4067	100 %	0 %	0 %	0 %	108562430
90	NC_008086	TCTT	2	8	4076	4083	0 %	75 %	0 %	25 %	108562430
91	NC_008086	T	7	7	4156	4162	0 %	100 %	0 %	0 %	108562430
92	NC_008086	T	7	7	4198	4204	0 %	100 %	0 %	0 %	108562430
93	NC_008086	AGC	2	6	4296	4301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108562430
94	NC_008086	GC	3	6	4309	4314	0 %	0 %	50 %	50 %	108562430
95	NC_008086	A	6	6	4347	4352	100 %	0 %	0 %	0 %	108562430
96	NC_008086	AG	3	6	4466	4471	50 %	0 %	50 %	0 %	108562430
97	NC_008086	GTG	2	6	4485	4490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108562430
98	NC_008086	AGA	2	6	4583	4588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108562430
99	NC_008086	GCC	2	6	4651	4656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108562430
100	NC_008086	TGC	2	6	4736	4741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108562431
101	NC_008086	GAA	2	6	4767	4772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108562431
102	NC_008086	GAAA	2	8	4841	4848	75 %	0 %	25 %	0 %	108562431
103	NC_008086	TG	3	6	4948	4953	0 %	50 %	50 %	0 %	108562431
104	NC_008086	GTT	2	6	5097	5102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108562431
105	NC_008086	ATC	2	6	5181	5186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108562431
106	NC_008086	AGAA	2	8	5297	5304	75 %	0 %	25 %	0 %	108562431
107	NC_008086	CAAG	2	8	5342	5349	50 %	0 %	25 %	25 %	108562431
108	NC_008086	A	6	6	5385	5390	100 %	0 %	0 %	0 %	108562431
109	NC_008086	ATT	2	6	5425	5430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108562431
110	NC_008086	GGC	2	6	5498	5503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108562431
111	NC_008086	GGT	2	6	5604	5609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008086	TAT	2	6	5652	5657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008086	TGG	2	6	5705	5710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008086	ATGC	2	8	5809	5816	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_008086	TGG	2	6	5825	5830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008086	GTG	2	6	5941	5946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008086	ACC	2	6	5973	5978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_008086	GGT	2	6	5986	5991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008086	T	8	8	6125	6132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008086	AAT	2	6	6146	6151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108562433
121	NC_008086	GAAAC	2	10	6175	6184	60 %	0 %	20 %	20 %	108562433
122	NC_008086	TAAA	2	8	6214	6221	75 %	25 %	0 %	0 %	108562433
123	NC_008086	A	7	7	6219	6225	100 %	0 %	0 %	0 %	108562433
124	NC_008086	T	8	8	6289	6296	0 %	100 %	0 %	0 %	108562433
125	NC_008086	TTA	2	6	6339	6344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008086	T	6	6	6356	6361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008086	A	6	6	6366	6371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008086	A	6	6	6382	6387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008086	TGT	2	6	6421	6426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008086	TTTTA	2	10	6454	6463	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008086	C	6	6	6500	6505	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
132	NC_008086	A	7	7	6506	6512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008086	A	8	8	6521	6528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008086	A	7	7	6535	6541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008086	AAG	2	6	6566	6571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008086	TAG	2	6	6687	6692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108562434
137	NC_008086	TGC	2	6	6719	6724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108562434
138	NC_008086	TCGC	2	8	6734	6741	0 %	25 %	25 %	50 %	108562434
139	NC_008086	T	6	6	6742	6747	0 %	100 %	0 %	0 %	108562434
140	NC_008086	CATT	2	8	6807	6814	25 %	50 %	0 %	25 %	108562434
141	NC_008086	ATT	2	6	6829	6834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108562434
142	NC_008086	C	6	6	6892	6897	0 %	0 %	0 %	100 %	108562434
143	NC_008086	TGG	2	6	6927	6932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108562434
144	NC_008086	A	6	6	7039	7044	100 %	0 %	0 %	0 %	108562434
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